Escudo de la República de Colombia

Ciencia & Tecnología

Software calcula propiedades de proteínas

El programa informático PepMultiFinder 1.0 ha permitido identificar fragmentos de proteínas de distintos orígenes con potencial antimicrobiano, antitumoral y antiviral.

Medellín, 02 de mayo de 2018Agencia de Noticias UN-

PepMultiFinder 1.0 está disponible para el sistema operativo Windows. Fotos: cortesía Sergio Orduz

El software pide seleccionar el archivo que contiene las secuencias de proteínas que se van a analizar.

Al hacer clic en “calcular” el software busca en los péptidos las propiedades requeridas.

Los resultados se pueden guardar en archivos de Excel.

El software ha tenido dos versiones anteriores.

Sergio Orduz, profesor de la Escuela de Biociencias de la Universidad Nacional de Colombia (U.N.) Sede Medellín. Foto: Unimedios.

El objetivo de este software es facilitar el tiempo y el trabajo de buscar moléculas antibióticas pequeñas que no hayan estado en contacto con aquellos microorganismos evolucionados durante millones de años y que han desarrollado resistencia al ataque de antibióticos, y a partir de estas crear otras.

La necesidad tiene que ver con que “muchas enfermedades causadas por virus o bacterias requieren nuevas moléculas para su tratamiento. Lo que se ha hecho es buscar en la naturaleza microbios que produzcan un antibiótico, aunque en ella también hay genes resistentes a ellos, por lo que se requieren unos nuevos”.

“Gracias a este programa se han identificado tanto moléculas derivadas de una bacteria y del virus que causa la influenza como de otras importantes para tratar microorganismos que causan infecciones en los ojos y en la piel”, explica Sergio Orduz, profesor de la Escuela de Biociencias de la Universidad Nacional de Colombia (U.N.) Sede Medellín.

El software funciona para el sistema operativo Windows y se ha perfeccionado desde 2013, cuando se desarrolló su versión inicial. En ese entonces solo permitía analizar una proteína y calcular propiedades fisicoquímicas como carga y porcentaje de aminoácidos.

PepMultiFinder 1.0 ofrece dos opciones: ingresar datos de un conjunto de proteínas que determinan un organismo cualquiera, o hacer una lista seleccionada de proteínas mediante archivos en un formato específico preparado previamente.

Para la última adaptación se quiso cuantificar e incluir la distribución de las propiedades fisicoquímicas a lo largo de las moléculas, específicamente de péptidos, según su ubicación en la secuencia de aminoácidos que lo conforman.

La modificación más reciente del software, realizada en 2017, consistió en automatizarlo para estudiar varias proteínas, de varios orígenes. El programa informático muestra los resultados después de que el usuario ajusta los filtros de datos necesarios para el análisis.

“En un principio trabajábamos casi que a mano, especialmente el profesor de la U.N. Viktor Lemeshko. Se leían las secuencias de una proteína y se decidía qué regiones de ella podrían tener valor antimicrobiano”, manifiesta el académico.

Agrega que es un trabajo arduo, de mucho tiempo y que solo lo pueden realizar expertos. Con ese argumento el profesor comenzó a vincular a estudiantes de Ingeniería Biológica y de Sistemas para desarrollar el software.

El uso del PepMultiFinder 1.0 permitió acortar los tiempos de las investigaciones, pasando de cuatro años a ocho meses.

El software, registrado a nombre de la U.N., es el único de este tipo en Colombia y actualmente se usa para investigación, aunque también es útil en docencia.

En general es de interés académico, ya que, según el profesor “para las compañías farmacéuticas es más rentable tratar enfermedades como Alzheimer o diabetes porque los pacientes requieren tomar el medicamento de por vida; de ahí que no tienen tanto interés en desarrollar nuevos antibióticos”.

(Por: Fin/KAGG/MLA/LOF
)
N.° 524

Otras noticias

La profesora Dolly Montoya Castaño, rectora de la U.N., visitó y recorrió la Sede Tumaco en compañía de los docentes y alumnos.

Educación

mayo 21 de 2018

La U.N. participa en el plan “Tumaco Renace”

Como integrante del Comité Cívico en representación del sector de la educación,...

En el tracto gastrointestinal de las cachamas blancas se encontraron <em>Bacillus</em> esporulados. Foto: cortesía Víctor Alfonso Castañeda Monsalve.

Ciencia & Tecnología

mayo 21 de 2018

Primera identificación de microbiota de cachama blanca

En el universo microscópico vivo del aparato digestivo de la cachama blanca se...

Los pares académicos destacaron el impacto que tiene la Maestría en la U.N. Fotos: Nicolás Bojacá / Unimedios

Educación

mayo 21 de 2018

Maestría en Educación busca acreditación de alta calidad

Los pares evaluadores, representantes del Consejo Nacional de Acreditación...

En Cumbal, una red de intercambio de semillas ha permitido que se consolide la agrobiodiversidad.

Desarrollo Rural

mayo 21 de 2018

En Nariño, con semillas ancestrales afrontan retos del clima

En Cumbal, el Centro de Conservación de Cultivos Andinos Nativos (CANA) cuenta...

Se estima que en un 40 % de los hogares colombianos se realiza algún tipo de apuesta.

Ciencia & Tecnología

mayo 21 de 2018

No pierda dinero en las apuestas de fútbol, apóyese en la estadística

El portal sin ánimo de lucro pronosticosfutbol.club, diseñado por estadísticos...

El documento “Reflexiones y propuestas estratégicas sobre las políticas mineras 2017” analiza la situación actual de la minería en el país. Foto: cortesía.

Economía & Organizaciones

mayo 21 de 2018

Generan análisis y propuestas sobre políticas mineras en Colombia

Un documento recoge sugerencias en los temas sociales, ambientales y legales...

El dispositivo se creó en la U.N. Sede Manizales.

Salud

mayo 21 de 2018

Dispositivo ayudaría a prevenir cirugía de túnel carpiano

Un medidor de fuerza para personas que presentan este síndrome en su fase...

El lanzamiento del Plan Especial de Manejo y Protección se llevó a cabo en el edificio de la Facultad de Ingeniería. Fotos: Nicolás Bojacá – Unimedios

Educación

mayo 18 de 2018

La U.N. lanza su Plan Especial de Manejo y Protección

Este plan, liderado por la Vicerrectoría de la Universidad Nacional de Colombia...

Se busca establecer alianzas entre las cuatro instituciones educativas participantes y las asociaciones de productores.

Desarrollo Rural

mayo 18 de 2018

Bachilleres del Caguán mejorarán producción de leche

Los jóvenes reciben capacitación en técnicas de renovación de praderas, mejor...

Economía & Organizaciones

mayo 18 de 2018

Inaugurado Laboratorio de Innovación para la Paz

Con esta iniciativa del CAF-Banco de Desarrollo de América Latina, The Trust...